После процесса выкопки и сортировки посадочный материал поступает на хранение. Существуют кратковременные и долговременные прикопки. Кратковременная прикопка осуществляется после выкопки, сортировки и пересчета посадочного материала на территории питомника, если его планируют использовать в ближайшую весну или осень.
Для прикопки целенаправленно выбирают защищенную от ветра и солнца ровную площадку. На площадке выкапывают канаву (15,0-25,0 см) с одной наклонной стенкой. На эту стенку выкладывают сеянцы с таким расчетом, чтобы корневая шейка находилась на 2,0-3,0 см ниже уровня земли. Потом корни засыпают землей. Каждую тысячу сеянцев отделяют определенным знаком. После засыпки корней почву уплотняют ногами. После этого прикопанные сеянцы можно прикрыть хворостом, который размещается на жердях высотой 30,0-55,0 см над уровнем земли. Кроме этого, в сухую погоду рекомендуется проводить полив почвы в междурядьях прикопанных сеянцев.
Для долговременной прикопки используют с осени яму глубиной 1,0-1,5 м. Зимой ее заполняют снегом или льдом. Лед накрывают соломой или мхом и слегка увлажняют. Над ямой изготавливают навес. Весной сеянцы укладывают на лед и укрывают мхом или соломой и слегка увлажняют. Долговременную прикопку проводят под зиму.
Кроме этого, следует отметить, что посадочный материал можно хранить 1-2 дня и без прикопки, при условии обработки корней специальными препаратами. Эти препараты препятствуют пересыханию корней и способствуют сохранению жизнеспособности посадочного материала древесных пород.